《机动战士高达SEED FREEDOM》为《机动战士高达SEED DESTINY》的续作，内容将为全新的故事，并以宇宙纪元（Cosmic Era）75 为背景。时值 C.E.75，战火仍未停歇，接连爆发了独立运动、蓝色宇宙策划的侵略行动等事件……为了平息事态，以拉克丝为首任总裁的世界和平监视机构「罗盘」就此创立，煌等人作为组织成员开始介入各地的斗争。就在此际，新兴国家「基金国」提议以联合作战形式进攻蓝色宇宙的总部。