一天，某个都市突然消失——

单干的运输员男子·拓也，与唯一从消灭中生还的少女小雪。两人靠着本以为音信全无的小雪父亲传来的信息，而开始前往消灭都市。

然而，两人面前出现了意想不到的阻碍。那是对于小雪而言，过于冲击的现实——

对幸存者的思念，暗中活跃的神秘组织，以及被隐藏起来的阴谋。拓也与小雪，原本素昧平生的两人，随着旅行逐渐加深关系，并逐渐逼近消灭都市的谜团。