时间为明治64年。

舞台为由德川庆喜持续掌权的另一个日本。

得益于对于独特的能源“龙脉”的完美掌控，这个国家实现了江户时代与科学发展的良好结合。

然而，在华丽的都市背后，反体制派组织クチナワ蠢蠢欲动，点燃革命的火焰，企图推翻政权。

为了能够消灭他们，德川政府设立了暗组织“鵺”。

而小时候家里人被杀害的雪村咲羽则成为了“鵺”的处刑人，同时，她也在寻找着她的仇敌——蛇埜目。