高中生永井圭因放學後遭遇了交通事故，暴露出自己身爲亞人的事實。 自那以後，便不得不走上被警察以及亞人管理委員會所追趕的人生。 設局讓圭在逃亡途中與其接觸的，是一位戴帽子的男人——亞人佐藤。 佐藤爲了教育圭，把他交給了亞人管理委員會。 然而，嘗試最終失敗。兩人決裂，佐藤與自己募集的亞人協助者們一起 制造了被稱作ground制藥爆破的大規模恐怖事件。 如今 把圭卷入事件的亞人恐怖分子——佐藤與亞人管理委員會的戰鬥迎來了新的局面。 “第2波的主題是，‘淨化’——” 來自佐藤的第二則犯罪預告其內容是與亞人相關的15名要人的連續暗殺計劃。 亞人對日本政府，佐藤對永井圭的，賭上國家存亡的最終大戰即將拉開帷幕。